案卷排列的顺序确定以后，应当逐卷地登记到案卷目录上。案卷目录也就是案卷的名册，它有重要的作用：第一，固定全宗内档案分类体系和案卷的排列次序；第二，介绍全宗内档案的内容与成分，是查找利用档案最基本的检索工作，也是编制专题卡片、全宗介绍等其它工具的基础；第三，它是档案登记的基本形式，也是统计和检查档案的重要依据。
    编制案卷目录，一般以全宗为单位。可以一个全宗编一本，也可以一个类编一本，还可以被案卷的保管期限、机密程序的不同分别编制。