就是按照文件内容所说明的问题进行分类。这种分类的优点，是使内容性质相同的文件得到集中，比较突出地反映一个机关主要工作活动的面貌，便于按专题查找和利用文件，也是一种比较常用的分类方法。但是，问题分类法又有一定的缺点：由于档案内容涉及的问题相当复杂，人们的认识则有局限和差异，因而对类目如何设置，文件怎样归类，往往难以掌握和意见分歧，致使分类不易准确。查找者的预想和实际的分类也常发生出入。因此，采用问题分类法应该慎重，特别是不要轻易打乱组织机构而先按问题分类。一般在下面两种情况下采用问题分类法：一是不适于按组织机构分类的时候；一是每个机构内文件相当多，需要再分属类的时候。

    按问题分类，必须遵循以下几项分类要求：

    （一）应该按照文件内容中最基本的问题来设置类别，如实地反映立档单位最主要的活动。一般多是参照机关的职权与任务（职掌），根据文件的实际状况而设类，不能根据一时的某种需要，任意地划分问题类别。

    （二）类目体系力求简明，必须合乎逻辑。类别概念的外延同全宗大小要相应，比如粮食 局全宗内不宜设置粮食类。各类之间应当平列，不能互相交杂不清，比如设有干部调配类，不能同时再设干部任免类。

    （三）按文件的主要内容有规律地归类。有些文件内容涉及几个问题，归类时要合理地解决：研究并找出文件内容中的主要问题，归入相应问题的类别；订出一些具有规定，作为按问题统一归类的依据；不能和不宜归入某个具体问题的文件，可以归入综合类或总类，但须注意综合类的文件不应过多。